En dicho año las autoridades del ministerio de Sanidad y Bienestar Social informaron de que sobre una población de unas 500.000 personas, la cifra de seropositivos había superado las 15.000 personas, de los que 200 habían desarrollado la enfermedad.

   En el mismo año anunciaron la creación del Consejo Nacional de Lucha contra el SIDA, presidida por el Jefe de Estado guineano, Teodoro Obiang.

   Asimismo, los últimos datos oficiales de fallecidos por el sida, 30 en total, datan de 1999, cuando el Programa Nacional de Lucha contra el Sida reconoció que el 9,98 por ciento de los test rápidos realizados dieron resultados positivos, de los que se confirmó, mediante análisis más fiables efectuados en el Instituto Carlos III de Madrid, la presencia de VIH en el 64 por ciento de los casos.

   En el informe de 2003, la Oficina de Lucha contra el Sida adelantó que la cifra de seropositivos será de 34.420 personas en el 2010.

   El entonces viceministro de Sanidad, Tomás Mecheba, del Partido Socialista de Guinea Ecuatorial (PSGE), reveló en conversación telefónica con EFE que "hay una incidencia del 80 por ciento de seropositivos entre los jóvenes, sobre todo, chicas de entre 13 y 35 años".

   Por otra parte, el informe denominado "Salud y Desarrollo" publicado en 2001 por el ministerio de Sanidad recordó que "los principales factores que alimentan la epidemia del VIH/Sida son la precocidad de las relaciones sexuales, la promiscuidad, la vulnerabilidad socio-económica de las mujeres y las jóvenes y el rechazo a la utilización de preservativos".

   Enumeró como razones adicionales "el uso abusivo del alcohol, el acceso limitado a los preservativos y la deficiente calidad de estos, el desconocimiento de la población respecto a la enfermedad y las medidas preventivas, así como la migración interna y externa".

   En 2002, Obiang incluyó por primera vez al Programa de Lucha Contra el Sida en los presupuestos generales del Estado, con una partida de 6,5 millones de euros, con la finalidad de establecer una estrategia de lucha.

   En junio de 2004 el Gobierno de Guinea Ecuatorial inauguró dos centros especializados para el tratamiento de víctimas del sida y seropositivos, tras reconocer años anteriores que la enfermedad "está causando estragos" en el país".